@MASTERSTHESIS{ 2023:854280655,
 	title = {Modelagem in silico do gene gumD e sua rede de interação em Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5},
 	year = {2023},
 	url = "http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/4806",
 	abstract = "A biologia de sistemas é um ramo da ciência que visa compreender as interações e 
 organização das partes moleculares, celulares e organismos para a produção dos 
 complexos processos biológicos. Para alcançar esse objetivo, são empregados 
 diversos métodos experimentais, incluindo genômica, proteômica e metabolômica, 
 bem como ferramentas computacionais sofisticadas, como modelagem matemática, 
 simulação e análise de redes complexas. Neste contexto, a Gluconacetobacter 
 diazotrophicus PAL5 se destaca como uma bactéria diazotrófica endofítica, 
 conhecida por sua tolerância ao ar e por desempenhar um papel fundamental na 
 fixação biológica de nitrogênio (FBN). Pesquisas evidenciaram que o gene gumD
 dessa bactéria é essencial para a produção de Exopolissacarídeos (EPS). O objetivo 
 deste trabalho é compreender a função da proteína GumD em G. diazotrophicus
 PAL5, especialmente relacionada à sua interação com as plantas. Para isso, foi 
 utilizada a modelagem in silico e construção de redes de interação dessa proteína. 
 Essa abordagem envolveu a obtenção de informações das proteínas em bancos de 
 dados como UniProt, NCBI, Prosite e Pfam. A modelagem 3D foi realizada utilizando 
 a ferramenta I-TASSER, e os modelos foram refinados e avaliados por meio do 
 ModRefiner e MolProbity, respectivamente. A visualização dos modelos foi feita no
 programa Chimera 1.16. A análise da rede de interação e Clusters, que foi realizada 
 utilizando o STRING, apontou que a proteína codificada pelo gene gumD está 
 envolvida nos processos de transferase de polissacarídeos. Os dados obtidos 
 sugerem que essa proteína está envolvida no transporte de polissacarídeos, o que 
 pode facilitar a formação do biofilme e, possivelmente, influenciar na interação da 
 bactéria G. diazotrophicus PAL5 com as plantas. É importante ressaltar que esses 
 resultados são baseados em análises computacionais e preditivas, sendo 
 necessários estudos experimentais adicionais para validar e confirmar as interações 
 e funções da proteína GumD. O aprofundamento dessas investigações contribuirá 
 para uma melhor compreensão do papel dessa proteína na relação bactéria-planta e 
 abrirá caminho para aplicações práticas na agricultura, como o desenvolvimento de 
 ferramentas biotecnológicas para aprimorar o rendimento das culturas.",
 	publisher = {Universidade Estadual da Paraíba},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA},
 	note = {Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - PRPGP}
}