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http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/3188
Tipo do documento: | Dissertação |
Título: | Identificação de uma nova fitase bacteriana através de prospecção metagenômica |
Título(s) alternativo(s): | Identification of a new bacterial phytase through metagenomic prospection |
Autor: | Farias, Nathálya Carvalho |
Primeiro orientador: | Meneses, Carlos Henrique Salvino Gadelha |
Primeiro membro da banca: | Neder, Diogo Gonçalves |
Segundo membro da banca: | Bonilla, German Andres Estrada |
Resumo: | A diversidade bacteriana de amostras ambientais e seu potencial ainda são pouco explorados. As abordagens metagenômicas oferecem a oportunidade para a prospecção de genes de interesse biotecnológico a partir de microrganismos não-cultiváveis em laboratório. Materiais em processo de compostagem exibem grande atividade microbiológica, o que torna o ambiente propício para a degradação de material lignocelulósico. Neste contexto, diversas enzimas vêm sendo identificadas por catalisarem estas reações. As fitases são enzimas fosfatases amplamente produzidas que hidrolisam o fitato liberando fósforo e minerais quelados. Devido a este potencial, estas enzimas têm se tornado facilmente interessantes para o campo biotecnológico. Procurou-se assim, investigar o potencial metagenômico para a identificação de genes com atividade fitásica. Após a obtenção do material, foi realizada a extração de DNA, seguida da etapa de purificação. Usou-se o DNA total extraído para construção de biblioteca metagenômica em vetor cosmídeo, através de kits comerciais (EPICENTRE). Os clones positivos para atividade fitásica foram sequenciados e analisados. A prospecção realizada neste estudo, identificou um gene (PhyRC001) que codifica uma fitase, onde, a identidade de aminoácidos entre PhyRC001 e os seus homólogos mais próximos publicados são inferiores a 60%. |
Abstract: | The bacterial diversity of environmental samples and their potencial are still poorly explored. Metagenomics approaches offer the opportunity for the prospection of genes with biotechnological interest from non-cultured microorganisms in the laboratory. Materials in the process of composting exhibit high microbiological activity, which indicates that the environment is conducive to the degradation of lignocellulosic material. In this context, several enzymes have been identified by catalyzing these reactions. Phytases are widely produced phosphatase enzymes that hydrolyze phytate by releasing phosphorus and chelated minerals. Due to this potential, these enzymes have become easily interesting for the biotech field. The aim was to investigate the metagenomic potential for the identification of genes with phytase activity. After obtaining the material, DNA extraction was performed, followed by its purification. Total extracted DNA was used to construct the metagenomic library with cosmid vector through commercial kits (EPICENTRE). Positive clones for phytase activity were sequenced and analyzed. The prospection carried out in this study identified a gene (PhyRC001) encoding a phytase where the amino acid identity between PhyRC001 and its nearest published homologs is less than 60%. |
Palavras-chave: | Oryza sativa L. Restos culturais Metagenômica funcional Functional metagenomics Cultural remains |
Área(s) do CNPq: | CIENCIAS AGRARIAS |
Idioma: | por |
País: | Brasil |
Instituição: | Universidade Estadual da Paraíba |
Sigla da instituição: | UEPB |
Departamento: | Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - PRPGP |
Programa: | Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA |
Citação: | FARIAS, N. C. Identificação de uma nova fitase bacteriana através de prospecção metagenômica. 2018. 67f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA) - Universidade Estadual da Paraíba, Campina Grande, 2018. |
Tipo de acesso: | Acesso Aberto |
URI: | http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/3188 |
Data de defesa: | 26-Fev-2018 |
Aparece nas coleções: | PPGCA - Dissertações |
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